SARS-CoV-2 ರ ತುಣುಕುಗಳು ಪ್ರತಿರಕ್ಷಣಾ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ಅನುಕರಿಸಲು ಮತ್ತು ಉರಿಯೂತವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲು ಕಂಡುಬಂದಿವೆ | Duda News

ಜರ್ನಲ್‌ನಲ್ಲಿ ಪ್ರಕಟವಾದ ಇತ್ತೀಚಿನ ಅಧ್ಯಯನದಲ್ಲಿ ನ್ಯಾಷನಲ್ ಅಕಾಡೆಮಿ ಆಫ್ ಸೈನ್ಸ್ ನ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳುತೀವ್ರವಾದ ತೀವ್ರವಾದ ಉಸಿರಾಟದ ಸಿಂಡ್ರೋಮ್ ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ 2 (SARS-CoV-2) ನ ವಿಘಟಿತ ಘಟಕಗಳ ಉರಿಯೂತದ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಸಂಶೋಧಕರು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಿದ್ದಾರೆ.

ಕರೋನವೈರಸ್ ಕಾಯಿಲೆ 2019 (COVID-19) ಸಾಂಕ್ರಾಮಿಕ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ತೀವ್ರವಾದ ಸಂಶೋಧನೆಯು SARS-CoV-2 ಸೋಂಕನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡಿದೆ. ಆದರೂ, ಅಪಾಯಕಾರಿ ಉರಿಯೂತದ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡಲು ವೈರಸ್ ಅನ್ನು ಯಾವುದು ಶಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಎಂಬುದು ಅಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿಯೇ ಉಳಿದಿದೆ. ಸಹಜ ಪ್ರತಿರಕ್ಷಣಾ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಿಂದ ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್, ಕ್ಯಾಟಯಾನಿಕ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳು ಅಯಾನಿಕ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳೊಂದಿಗೆ ಅಮಿಲಾಯ್ಡ್-ರೀತಿಯ ಸಂಯೋಜನೆಗೆ ಒಳಗಾಗುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಇನ್‌ಫ್ಲಮೇಟರಿ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಸಂಶೋಧನೆ ಸೂಚಿಸಿದೆ.

ಅಧ್ಯಯನ: ವೈರಲ್ ಮರಣಾನಂತರದ ಜೀವನ: SARS-CoV-2 ಇಮ್ಯುನೊಮಿಮೆಟಿಕ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳ ಜಲಾಶಯವಾಗಿ ಇದು ಪ್ರೊಇನ್‌ಫ್ಲಮೇಟರಿ ಸುಪ್ರಮೋಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳಾಗಿ ಮರುಜೋಡಿಸುತ್ತದೆ., ಚಿತ್ರ ಕೃಪೆ: NIAID

ಅಧ್ಯಯನ ಮತ್ತು ಸಂಶೋಧನೆಗಳು

ಪ್ರಸ್ತುತ ಅಧ್ಯಯನವು ವಿಘಟಿತ SARS-CoV-2 ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳು ಅಯಾನಿಕ್ ಡಬಲ್-ಸ್ಟ್ರಾಂಡೆಡ್ ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ (ಡಿಎಸ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ) ಯೊಂದಿಗೆ ಸೂಪರ್‌ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳಲ್ಲಿ ಒಟ್ಟುಗೂಡುತ್ತವೆಯೇ ಎಂದು ತನಿಖೆ ಮಾಡಿದೆ. ವೈರಸ್ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮ್ ಅನ್ನು ವೈರಸ್‌ಗಳ ಪ್ರೋಟಿಯೋಲೈಟಿಕ್ ನಾಶದ ನಂತರ ಬಿಡುಗಡೆಯಾದ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ತುಣುಕುಗಳ ಜಲಾಶಯ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ. SARS-CoV-2 ಪ್ರೋಟಿಯೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಆಂಟಿಮೈಕ್ರೊಬಿಯಲ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ (AMP) ತರಹದ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು (xenoAMP ಗಳು) ಗುರುತಿಸಲು ಸಂಶೋಧಕರು ಬೆಂಬಲ ವೆಕ್ಟರ್ ಯಂತ್ರ (SVM) ವರ್ಗೀಕರಣವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸಿದರು.

ಸಂಭಾವ್ಯ xenoAMP ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಮತ್ತು ವಿವಿಧ ಸ್ಥಳಗಳಲ್ಲಿ ಸೀಳಿದಾಗ ಅವು AMP ಗಳಂತೆ ವರ್ತಿಸುತ್ತವೆಯೇ ಎಂದು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲು, ವೈರಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು 24-34 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಚಲಿಸುವ ವಿಂಡೋ ಮೂಲಕ ಸ್ಕ್ಯಾನ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸಿಗ್ಮಾ (σ) ಸ್ಕೋರ್‌ನ ರೂಪದಲ್ಲಿ ವರ್ಗೀಕರಣವು ಒದಗಿಸಿದ ಔಟ್‌ಪುಟ್‌ನ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆಮಾಡಲಾಗಿದೆ, ಹೆಚ್ಚು ಧನಾತ್ಮಕ ಸ್ಕೋರ್ ಅಂದರೆ ಅನುಕ್ರಮವು AMP ಆಗಿರುವ ಸಾಧ್ಯತೆ ಹೆಚ್ಚು.

SARS-CoV-2 ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೊ-ಇನ್‌ಫ್ಲಮೇಟರಿ ಹೋಸ್ಟ್ ಆಂಟಿಮೈಕ್ರೊಬಿಯಲ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳ (xenoAMPs) ಬಾಹ್ಯ ಅನುಕರಣೆಗಳ ಅಸ್ತಿತ್ವ.  (A) SARS-CoV-2 ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಯಂತ್ರ-ಕಲಿಕೆ AMP ವರ್ಗೀಕರಣದೊಂದಿಗೆ ಸ್ಕ್ಯಾನ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ.  ಪ್ರತಿ ಪ್ರಶ್ನಿಸಿದ ಅನುಕ್ರಮವು ಅದರ AMP-ನೆಸ್ ಅನ್ನು ಅಳೆಯುವ σ ಸ್ಕೋರ್ ಅನ್ನು ನೀಡಲಾಗುತ್ತದೆ.  ಮೂರು ಪ್ರಾತಿನಿಧಿಕ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ: xenoAMP(ORF1ab), xenoAMP(S), ಮತ್ತು xenoAMP(M).  ಗ್ರೇ ಬಾರ್‌ಗಳು ಅನುಗುಣವಾದ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಿದ ಸ್ಥಾನಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತವೆ.  (B) SARS-CoV-2 ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್‌ಗಳನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯ ಶೀತ ಹ್ಯೂಮನ್ ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ HCoV-OC43 ನಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಹೋಮೊಲಾಗ್‌ಗಳಿಗೆ ಜೋಡಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಹೋಲಿಸಲಾಗಿದೆ: ನಿಯಂತ್ರಣ (ORF1ab), ನಿಯಂತ್ರಣ (S), ಮತ್ತು ನಿಯಂತ್ರಣ (M).  ನಕ್ಷತ್ರ ಚಿಹ್ನೆಗಳು, ಕೊಲೊನ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಅವಧಿಗಳು ಕ್ರಮವಾಗಿ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಸ್ಥಾನಗಳನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ, ಬಲವಾಗಿ ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ ಮತ್ತು ದುರ್ಬಲವಾಗಿ ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ.  ClustalX ಸ್ಕೀಮ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಶೇಷಕ್ಕೆ ಬಣ್ಣವನ್ನು ನಿಗದಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ.  (C) SARS-CoV-2 ಮತ್ತು HCoV-OC43 ನಿಂದ ಮೂರು ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ-ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ವಿತರಣೆಯನ್ನು ಹೋಲಿಸುವ σ ಸ್ಕೋರ್ ಹೀಟ್‌ಮ್ಯಾಪ್.  ಪ್ರತಿ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿನ ಮೊದಲ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲವು ಅದರ ಸರಾಸರಿ σ ಸ್ಕೋರ್‌ಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ ಬಣ್ಣವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ;  ಋಣಾತ್ಮಕ ಸರಾಸರಿ σ ಅಂಕಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರದೇಶಗಳು (AMP ಅಲ್ಲದ) ಬಿಳಿ ಬಣ್ಣವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ.  SARS-CoV-2 ಗಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳು (ಪ್ರಕಾಶಮಾನವಾದ ಹಳದಿ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಕೆಂಪು ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗಳಲ್ಲಿ ಬ್ರಾಕೆಟ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ)

SARS-CoV-2 ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೊ-ಇನ್‌ಫ್ಲಮೇಟರಿ ಹೋಸ್ಟ್ ಆಂಟಿಮೈಕ್ರೊಬಿಯಲ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳ (xenoAMPs) ಬಾಹ್ಯ ಅನುಕರಣೆಗಳ ಅಸ್ತಿತ್ವ. (A) SARS-CoV-2 ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಯಂತ್ರ-ಕಲಿಕೆ AMP ವರ್ಗೀಕರಣದೊಂದಿಗೆ ಸ್ಕ್ಯಾನ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. ಪ್ರತಿ ಪ್ರಶ್ನಿಸಿದ ಅನುಕ್ರಮವು ಅದರ AMP-ನೆಸ್ ಅನ್ನು ಅಳೆಯುವ σ ಸ್ಕೋರ್ ಅನ್ನು ನೀಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಮೂರು ಪ್ರಾತಿನಿಧಿಕ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ: xenoAMP(ORF1ab), xenoAMP(S), ಮತ್ತು xenoAMP(M). ಗ್ರೇ ಬಾರ್‌ಗಳು ಅನುಗುಣವಾದ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಿದ ಸ್ಥಾನಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತವೆ. (B) SARS-CoV-2 ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್‌ಗಳನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯ ಶೀತ ಹ್ಯೂಮನ್ ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ HCoV-OC43 ನಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಹೋಮೊಲಾಗ್‌ಗಳಿಗೆ ಜೋಡಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಹೋಲಿಸಲಾಗಿದೆ: ನಿಯಂತ್ರಣ (ORF1ab), ನಿಯಂತ್ರಣ (S), ಮತ್ತು ನಿಯಂತ್ರಣ (M). ನಕ್ಷತ್ರ ಚಿಹ್ನೆಗಳು, ಕೊಲೊನ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಅವಧಿಗಳು ಕ್ರಮವಾಗಿ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಸ್ಥಾನಗಳನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ, ಬಲವಾಗಿ ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ ಮತ್ತು ದುರ್ಬಲವಾಗಿ ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ClustalX ಸ್ಕೀಮ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಶೇಷಕ್ಕೆ ಬಣ್ಣವನ್ನು ನಿಗದಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ. (C) SARS-CoV-2 ಮತ್ತು HCoV-OC43 ನಿಂದ ಮೂರು ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ವಿತರಣೆಯನ್ನು ಹೋಲಿಸುವ σ ಸ್ಕೋರ್ ಹೀಟ್‌ಮ್ಯಾಪ್. ಪ್ರತಿ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿನ ಮೊದಲ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲವು ಅದರ ಸರಾಸರಿ σ ಸ್ಕೋರ್‌ಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ ಬಣ್ಣವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ; ಋಣಾತ್ಮಕ ಸರಾಸರಿ σ ಅಂಕಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರದೇಶಗಳು (AMP ಅಲ್ಲದ) ಬಿಳಿ ಬಣ್ಣವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. SARS-CoV-2 (ಕೆಂಪು ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗಳಲ್ಲಿ ಬ್ರಾಕೆಟ್ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರಕಾಶಮಾನವಾದ ಹಳದಿ ಪ್ರದೇಶಗಳು) ಗಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳ “ಹಾಟ್ ಸ್ಪಾಟ್” ಕ್ಲಸ್ಟರ್‌ಗಳು ವ್ಯವಸ್ಥಿತವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸ್ಕೋರ್‌ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ ಮತ್ತು HCoV-OC43 ಗಿಂತ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಸ್ಪೇಸ್‌ನ ವಿಶಾಲ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಇದು ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರವೃತ್ತಿಯು SARS-CoV-2 ನಲ್ಲಿನ ಹಾಟ್ ಸ್ಪಾಟ್‌ಗಳು HCoV-OC43 ಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ಎಂಜೈಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಕ್ಲೀವೇಜ್ ಸೈಟ್‌ಗಳಿಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ರಚಿಸಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.

ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ತಂಡವು ಹೆಚ್ಚಿನ ಕ್ಯಾಟಯಾನಿಕ್ ಚಾರ್ಜ್‌ನೊಂದಿಗೆ (ಹೆಚ್ಚಿನ ಸ್ಕೋರಿಂಗ್) ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಈ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯಿಂದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಿದೆ. ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ, ಅವರು ಮೆಂಬರೇನ್ (M) ಪ್ರೋಟೀನ್, ಸ್ಪೈಕ್ (S) ಪ್ರೊಟೀನ್ ಮತ್ತು ಓಪನ್ ರೀಡಿಂಗ್ ಫ್ರೇಮ್ 1ab (ORF1ab) ಪಾಲಿಪ್ರೋಟೀನ್‌ನಿಂದ ಮೂಲಮಾದರಿಯ ಅಭ್ಯರ್ಥಿಗಳ ಮೇಲೆ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸಿದರು. ಸಿಲಿಕೋದಲ್ಲಿ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಮೆಟಾಲೋಪ್ರೋಟೀನೇಸ್ 9 (MMP9) ಮತ್ತು ನ್ಯೂಟ್ರೋಫಿಲ್ ಎಲಾಸ್ಟೇಸ್ (NE) ಅವುಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುವುದರೊಂದಿಗೆ ಪ್ರೋಟಿಸೋಮಲ್ ಅವನತಿಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಈ xenoAMP ಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಬಹುದು ಎಂದು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿದವು.

ಮುಂದೆ, ತಂಡವು SARS-CoV-2 xenoAMP ಗಳನ್ನು SARS-CoV-1 ಮತ್ತು ಸಾಂಕ್ರಾಮಿಕವಲ್ಲದ ಮಾನವ CoV ಗಳಿಂದ ಏಕರೂಪದ ಅನುಕ್ರಮಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದೆ. ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಭಾಗಶಃ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ಇದು ತೋರಿಸಿದೆ. SARS-CoV-2 ಮತ್ತು HCoV-OC43 ನಡುವಿನ ORF1ab, S, ಮತ್ತು M ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳ σ ಸ್ಕೋರ್ ಹೀಟ್ ಮ್ಯಾಪ್‌ನ ಹೋಲಿಕೆಯು ಹೆಚ್ಚಿನ ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಹಾಟ್‌ಸ್ಪಾಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಕ್ಲಸ್ಟರ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ, SARS-CoV-2 ಹಾಟ್‌ಸ್ಪಾಟ್‌ಗಳು ಹೆಚ್ಚಿನ ಸ್ಕೋರ್‌ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು ಮತ್ತು ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಹರಡಿವೆ. ಪ್ರದೇಶಗಳು. HCoV-OC43 ಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ.

ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ತೀವ್ರವಾದ COVID-19 ರೋಗಿಗಳಿಂದ ಶ್ವಾಸನಾಳದ ಆಸ್ಪಿರೇಟ್ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿಯನ್ನು ನಡೆಸಲಾಯಿತು. ತಂಡವು 20 ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ (29 ರಲ್ಲಿ) ಹೋಸ್ಟ್ AMP, ಕ್ಯಾಥೆಲಿಸಿಡಿನ್ LL-37 ನ ತುಣುಕುಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿದಿದೆ. ಇದಕ್ಕೆ ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ, 28 ಮಾದರಿಗಳು ವೈರಲ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ತುಣುಕುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಕೆಲವು xenoAMP ಗಳಾಗಿ ಅರ್ಹತೆ ಪಡೆಯಲು ಸಾಕಷ್ಟು ಹೆಚ್ಚಿನ σ ಅಂಕಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದವು.

ಮೂರು xenoAMP ಗಳು, xenoAMP(S), xenoAMP(M), ಮತ್ತು xenoAMP(ORF1ab), LL-37 ನಂತೆಯೇ ಸಂಕೀರ್ಣದಲ್ಲಿ dsRNA ಯೊಂದಿಗೆ ಬಂಧಿಸಲು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕವಾಗಿ ಗಮನಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪಾಲಿನೋಸಿನ್:ಪಾಲಿಸಿಟಿಡಿಲಿಕ್ ಆಮ್ಲವನ್ನು (ಪಾಲಿ(I:C)) ಪುನರಾವರ್ತನೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ ವೈರಲ್ ಡಿಎಸ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎಯನ್ನು ಅನುಕರಿಸಲು ಸಿಂಥೆಟಿಕ್ ಅನಲಾಗ್‌ನಂತೆ ಬಳಸಲಾಯಿತು xenoAMP-poly(I:C) ಸಂಕೀರ್ಣಗಳ ರಚನೆಗಳು ಹೋಸ್ಟ್ AMP-dsRNA ಸಂಕೀರ್ಣಗಳು ಏಕರೂಪವಾಗಿದ್ದವು.

ಮುಂದೆ, ತಂಡವು ಸೂಕ್ತವಲ್ಲದ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಈ ಸ್ವಯಂ-ಸಂಯೋಜಿತ ಪ್ರೋಇನ್‌ಫ್ಲಮೇಟರಿ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳ ದೃಢತೆಯನ್ನು ಪರಿಶೀಲಿಸಿತು. ಭಾಗವಹಿಸುವ xenoAMP ಗಳನ್ನು ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತಗೊಳಿಸಿದಾಗ ನ್ಯಾನೊಕ್ರಿಸ್ಟಲಿನ್ ರಚನೆಗಳನ್ನು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ಅವರು ಕಂಡುಕೊಂಡರು. ಇದಲ್ಲದೆ, SARS-CoV-2 xenoAMP ಗಳು LL-37 ನೊಂದಿಗೆ ಸಹ-ಸ್ಫಟಿಕೀಕರಣಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ, ಇದು ಹೋಸ್ಟ್ AMP ಗಳು ಮತ್ತು xenoAMP ಗಳು ಉರಿಯೂತದ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಸಿನರ್ಜಿಸ್ಟಿಕ್ ಆಗಿ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.

SARS-CoV-2 ನಿಂದ xenoAMP ಗಳ ಪ್ರತಿರಕ್ಷಣಾ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಮಾನವ ಮೊನೊಸೈಟ್‌ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು HCoV-OC43 ನಿಂದ ಹೋಮೋಲೋಗಸ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸಲಾಗಿದೆ. XenoAMP-poly(I:C)-ಚಿಕಿತ್ಸಿಸಿದ ಮೊನೊಸೈಟ್‌ಗಳು ಪಾಲಿ(I:C)-ಚಿಕಿತ್ಸೆ ನಿಯಂತ್ರಣಗಳಿಗಿಂತ 1.7-ಪಟ್ಟು ಹೆಚ್ಚು ಇಂಟರ್‌ಲ್ಯೂಕಿನ್ (IL)-8 ಅನ್ನು ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡುತ್ತವೆ. ಇದಕ್ಕೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ, HCoV-OC43 ನಿಂದ ಹೋಮೋಲೋಗಸ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳಿಂದ ಕೂಡಿದ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳು IL-8 ಮಟ್ಟವನ್ನು ಬಹಳವಾಗಿ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಿತು.

ಇದಲ್ಲದೆ, ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಮಾನವ ಚರ್ಮದ ಮೈಕ್ರೊವಾಸ್ಕುಲರ್ ಎಂಡೋಥೀಲಿಯಲ್ ಕೋಶಗಳ (HDMVECs) XenoAMP-ಪಾಲಿ (I:C) ಪ್ರಚೋದನೆಯು IL-6 ನ ದೃಢವಾದ ಉತ್ಪಾದನೆಯನ್ನು ಪ್ರಚೋದಿಸಿತು, ಇದು HCoV-OC43 ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳಿಂದ ಕೂಡಿದ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳೊಂದಿಗೆ ಕಂಡುಬಂದಿಲ್ಲ. ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ, xenoAMP-poly(I:C)-ಚಿಕಿತ್ಸೆಯ HDMVEC ಗಳು ಹಲವಾರು ಪ್ರೊಇನ್‌ಫ್ಲಮೇಟರಿ ಕೆಮೊಕಿನ್ ಮತ್ತು ಸೈಟೊಕಿನ್ ಜೀನ್‌ಗಳ ಗಮನಾರ್ಹವಾದ ನಿಯಂತ್ರಣವನ್ನು ತೋರಿಸಿದೆ.

ಅಂತಿಮವಾಗಿ, ಸಂಶೋಧಕರು ಇಲಿಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿರಕ್ಷಣಾ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಅಳೆಯುತ್ತಾರೆ. ಸೋಂಕಿಗೆ ಒಳಗಾಗದ C57BL/6 ಇಲಿಗಳನ್ನು xenoAMP(ORF1ab)-poly(I:C) ಸಂಕೀರ್ಣಗಳು ಅಥವಾ poly(I:C)-ಏಕಾಂಗಿ (ನಿಯಂತ್ರಣ) ಮೂಲಕ ಚಿಕಿತ್ಸೆ ನೀಡಲಾಯಿತು. XenoAMP(ORF1AB)-poly(I:C) ಚಿಕಿತ್ಸೆಯು IL-6 ಮತ್ತು CXC ಮೋಟಿಫ್ ಕೆಮೊಕಿನ್ ಲಿಗಾಂಡ್ 1 (CXCL1) ನ ಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿ 1.6- ಮತ್ತು 2.2-ಪಟ್ಟು, ಪಾಲಿ(I:C) ನೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಹೆಚ್ಚಿಸಿತು. ಇದಲ್ಲದೆ, ನಿಯಂತ್ರಣ ಚಿಕಿತ್ಸೆಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಶ್ವಾಸಕೋಶದಲ್ಲಿ IL-6 ಮತ್ತು CXCL1 ಮಟ್ಟಗಳು 1.2 ಪಟ್ಟು ಹೆಚ್ಚಾಗಿದೆ.

ತೀರ್ಮಾನ

ಸಾರಾಂಶದಲ್ಲಿ, ಅಧ್ಯಯನವು COVID-19 ನಲ್ಲಿ ಸೋಂಕಿತ ಕೋಶಗಳ ಮೂಲಕ ಹರಡುವ ಉರಿಯೂತದ ಅನಿರೀಕ್ಷಿತ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವನ್ನು ವಿವರಿಸಿದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ವೈರಲ್ ತುಣುಕುಗಳು LL-37 ನಂತಹ AMP ಗಳನ್ನು ಅನುಕರಿಸುತ್ತವೆ. COVID-19 ನಲ್ಲಿನ ಆತಿಥೇಯ ಪ್ರತಿರಕ್ಷಣಾ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯು ರುಮಟಾಯ್ಡ್ ಸಂಧಿವಾತ ಮತ್ತು ಲೂಪಸ್‌ನಂತಹ ಸ್ವಯಂ ನಿರೋಧಕ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳನ್ನು ಏಕೆ ಹೋಲುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು ಇದು ಮುಖ್ಯವಾಗಬಹುದು.

ಆತಿಥೇಯ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್‌ಗಳು xenoAMP ಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಬಹುದು ಎಂದು ಸಂಶೋಧಕರು ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದಾರೆ, xenoAMP ಉತ್ಪಾದನೆಯನ್ನು ನಿಗ್ರಹಿಸುವ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ ಪ್ರತಿರೋಧಕಗಳು ವೈರಲ್-ಪ್ರೇರಿತ ಉರಿಯೂತದ ಮೇಲೆ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಪರಿಣಾಮಗಳನ್ನು ಬೀರಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. SARS-CoV-2 ನ ಪ್ರೋಟಿಯೋಲೈಟಿಕ್ ಅವನತಿಯು ಅತಿಥೇಯ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳಾದ್ಯಂತ ಬದಲಾಗಬಹುದು, ಇದು ಸೋಂಕಿನ ಫಲಿತಾಂಶಗಳ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಸಮರ್ಥವಾಗಿ ವಿವರಿಸಬಹುದು, ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಲಕ್ಷಣರಹಿತ ಮತ್ತು ಮಾರಕ.

ಜರ್ನಲ್ ಉಲ್ಲೇಖ:

  • ಜಾಂಗ್ ವೈ, ಭಾರತಿ ವಿ, ಡೊಕೊಶಿ ಟಿ, ಮತ್ತು ಇತರರು. ವೈರಲ್ ಮರಣಾನಂತರದ ಜೀವನ: SARS-CoV-2 ಇಮ್ಯುನೊಮಿಮೆಟಿಕ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳ ಜಲಾಶಯವಾಗಿ ಇದು ಪ್ರೊಇನ್‌ಫ್ಲಮೇಟರಿ ಸುಪ್ರಮೋಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳಾಗಿ ಮರುಜೋಡಿಸುತ್ತದೆ. Proc Natl Acad Sci USA2024, ನಾನ: 10.1073/pnas.2300644120,